起動時にMac OS 9.2と出るなら9.2.1へのアップデートは成功していると考えて良いでしょう。 ただ、アップデート時に警告が出たのが気にならなくはないので、9.2.2へアップデートを掛ける前にユーティリティー・フォルダの中にあるDisk First Aidを起動してHDDの修復を行なって下さい。
この上でデスクトップ上にあるファイル類はゴミ箱に捨てて構いません。 たぶんダウンロード時に何度もダウンロードを(自分ではそうとは気付かずに)行なってしまっただけです。
続けてMac OS 9.2.2へアップデートを掛けて下さい。 アップデータは以下からダウンロードし、ローカルでアップデートした方が確実です。
http://www.apple.com/jp/ftp-info/reference/macos_9.2.2_update.html
デスクトップ上でのHDDの名前は何と表示されています? 名称未設定になっていません?
デスクトップ上での表示は名称未設定になっていないならPRAMクリア、デスクトップファイルの再構築を行なった方が良いと思います。
再起動して直ぐ「comand + option + p + r 」を押しっ放しにし、起動音が三回鳴るまでやり過ごしたら「 p + r 」だけを離し(comand + option はまだ押しっ放し)起動するのを待ちます。 Finderに到達したら「デスクトップファイルを作り直しますか?」とコンピュータが訊いてくるのでO.K.します。 HDDが違うものになっていたら名前の部分を長押し反転させ、名前を好きに変更して下さい。