<Invasion> "Three years ago, Revan and Malak returned at the head of a massive invasion fleet. Revan had assumed the title of Sith Lord; the hero had become a conqueror." ―Dorak
The Second Sith Warが始まると、Darth RevanとDarth MalakのSith艦隊は最初から優勢を保っていた。さらに共和国側にとってはそれに追い討ちをかける様に、Mandalorian Warsの英雄であったSaul Karath提督が突然の裏切り行為を見せ、彼の艦隊(旗艦はLeviathan)や共和国軍の暗号や戦略の知識と共にSith軍側に合流した。すぐにDarth Malakは、Karath提督の忠誠を試す意味もあって、共和国軍の重要拠点である惑星Telos IVを攻撃する様に命令する。Karath提督は命令に従いTelos IVの生態システムを破壊するまでに容赦ない爆撃を行った。
その後もDarth Revanの指揮下によるSithの侵略は殆ど止める事が出来ないほど熾烈を極める。一方、Malachor V からはSithの秘密部隊が派遣され、共和国軍に組するJediを暗殺或いは拉致する作戦に出た。拉致されたJedi達は、Lehon, Dxun或いはKorriban等のDark Sideが強く宿る惑星に再建されたSith Academyに送られ、Dark Sideに導かれた。また、Sithは銀河系で最も勢力を誇ったCzerka Corporationと結託する事によって、多くの必需品を容易に入手する事ができた。この様にSithの勢力が拡大して多くの地域がSithによって征服されると、Sithに無条件に降伏するケースが多くなった。ある者は、Telos星系の様に自分の土地を破壊されたくなかったかもしれないし、共和国軍に勝つ見込みが無いと悟りSith側につく者もあったし、Jediの中でもSithの甘言やパワーに魅了されてDark Sideに転ずる者も少なくはなかった。
<Darth Malak> "It's obvious that Malak is a ruthless tyrant who'll crush any one who stands in his way… just like Revan was. Experience has shown that the Sith won't stop until the Republic lies in ruins." ―Carth Onasi[src]
Darth MalakはRevanの抹殺に成功したと信じ、自身をDark Lord of the Sithと呼ぶ事となる。Revanを除去する事に成功したJediと共和国軍であったが、MalakもRevanと同様に強力で、Saul Karathに率いられたSith艦隊も引き続き共和国の領地を征服し続けた。しかし、MalakとRevanのビジョンには違いがあった。Revanは戦争後の復興の事を考えて(True Sithの侵略を念頭に入れて)銀河共和国の最低限の秩序は存続させる事を前提にしていたのに対し、Malakは単に破壊と虐殺にあけくれていた。