USBメモリにしたら無くす人がいるしなぁ

単に記録媒体の問題ではないと思う。仮にネットワーク経由でも良いとなるとIT化進んでいない地方自治体は厳しいんじゃないかな？

脱フロッピーディスク？　デジタル庁、行政手続きでの記録媒体の指定撤廃へ
https://news.mixi.jp/view_news.pl?media_id=40&from=diary&id=7091640