憲法第12条

第十二条　この憲法が国民に保障する自由及び権利は、国民の不断の努力によつて、これを保持しなければならない。又、国民は、これを濫用してはならないのであつて、常に公共の福祉のためにこれを利用する責任を負ふ。

憲法で自由は保障されていますが、無制限ではありません。
表現の自由も無制限ではなく、国が保証する代わりに、公共の福祉の為に使う責任を負っています。
公共の福祉とは、「社会全体の共通の利益を守るために、基本的人権の行使に一定の制限を認める」という憲法上の原理です。

ですから、表現の自由は無制限の自由ではないという事です。
ここを横に置くから、訳の分からない話をし始めるのではありませんか？


憲法12条に抵触しないようにすれば、罰せられる事は無いわけですよ。

通称、国旗毀損罪の条文は、以下の通りです。

第二編第四章の次に次の一章を加える。
第四章の二　国旗損壊の罪

第94条の2　日本国に対して侮辱を加える目的で、国旗を損壊し、除去し、又は汚損した者は、二年以下の懲役又は二十万円以下の罰金に処する。

条文に出ていない部分で、実際の運用の話として、

制作物は対象から除外
毀損する状況をライブで他者に見せる罰せられる。
但し、逮捕の要件として、その毀損内容が、一般的な国民が著しく不快に感じた場合としています。

表現の自由の侵害と言いますが、仮に無制限の自由だとしても、制限を受けるのは、

人前で国旗を毀損する過程を見せ、且つ、その内容が、一般的な感覚で著しく不快と感じさせる事。

という極々狭い範囲の無いようになっています。
また条文で国旗と使われる場合、「国旗及び国歌に関する法律」で定義されている国旗になります。これ以外の物として、「社会通念上認められる有体物」と対かされているわけです。
この話について、「日の丸弁当は該当しますか」という話がありました。
日の丸弁当は、社会通念上、国旗として認められているのですか？

これも屁理屈ですが、

国旗毀損罪は、大切に扱わないと罰せられる。という観念が生まれ、愛国心の矯正に繋がる。

まだ、こちらの話の方が、理解しやすいです。
表現の自由を盾に話をするわけですが、その表現を誰かを傷つける恐れのある表現であれば、慎む事を考えないのでしょうか。
ごく一般的な配慮で十分なレベルの話だと思います。
表現の自由への配慮をしている法に対して、表現の自由を盾に反対をするのは、自分達が、国旗を人前で毀損する可能性のある団体だと言っているようなものだと思いますけどね。
抗議文を予め国旗に記載して、それを担いでデモを行う分には、罰しないと言っているのですから。


■国旗損壊罪「表現の自由制限」＝学者ら１４０人超が反対声明
(時事通信社 - 07月09日 15:01)
https://news.mixi.jp/view_news.pl?media_id=4&from=diary&id=8860724

　参院で実質審議入りした国旗損壊処罰法案について、刑事法学者ら１４８人が９日、「表現の自由が制限される」として反対する声明を発表した。東京都内で記者会見した呼び掛け人の松宮孝明・立命館大法科大学院特任教授は「これだけ賛同の声が寄せられた。専門家はおかしいと感じていることを国会に届けたい」と話した。

　法案は「人に著しく不快または嫌悪の情を催させる方法」で公然と国旗を傷つけるなどした場合、２年以下の拘禁刑か２０万円以下の罰金を科すと定めている。

　声明は「社会通念上認められる有体物」とした国旗の定義が漠然かつ不明確で、「政治的表現の自由を規制し、萎縮させる恐れが強い」と指摘。国旗に対する考え方は人によって異なるため、「『不快だ』という感情を理由に処罰規定を作ってはならない」と訴えた。