観光目的や京都らしい(?)といった要素抜きで良ければ、「Dessert & Bar Krepe」(gion ghostから店名・営業内容変更)、「BLUE FIR TREE」あたりを。
いずれも夜はバーとして営業されており、カウンターメインですので、1人でも入りやすいかと思います。
ただし、いずれもカフェ飯を出すようなお店ではないので、あらかじめご承知置きを。
(私自身が、カフェ飯に興味がないので)
情報誌を見て気になっている店を挙げてもらえれば、また別のアドバイスも出来るかと思います。
以下、行った時の日記ですが参考になれば。
Dessert & Bar Krepe
→http://mixi.jp/view_diary.pl?id=1688097172&owner_id=6112183
BLUE FIR TREE
→http://mixi.jp/view_diary.pl?id=1680938320&owner_id=6112183