私が知る限り、たとえば DVD Studio Pro でハードディスク上に「構築」したフォルダをそのままDVD-Rに書き込むと、プレイヤーによっては再生しません。DVD-Video の規格にないファイルが含まれているからです。DVD Studio Pro でマスタリングしたDVD-Rなら、これらのファイルは取り除かれるので大丈夫です。
それから、DVD Studio Pro で「構築」したフォルダから、DVD-Video 規格外のレイアウト情報ファイルを取り除いたとして、それを他のソフトでDVD-Rに書き込む時に、日本語のディスク名などを付けると規格外になりますので、全く再生しないプレイヤーがあってもおかしくありません。