『クリック―佐藤雅彦 超・短編集』(講談社 ISBN 978-4062089609 1998年3月) 『プチ哲学』(マガジンハウス ISBN 978-4838712267 2000年6月) 『キノの本 ビデオ付き テキストブック』(マドラ出版 ISBN 978-4944079162 2000年9月) 『ねっとのおやつ』(マガジンハウス ISBN 978-4838713509 2002年7月) 文庫版タイトル『四国はどこまで入れ替え可能か』(新潮社 ISBN 978-4101233413 2005年10月)。 CDROM版(マガジンハウス ISBN 978-4838713516 2002年7月)。 『毎月新聞』(毎日新聞社 ISBN 978-4620316185 2003年3月) 『砂浜』(紀伊國屋書店 ISBN 978-4314009638 2004年7月) 『トゥーチカと飴』(紀伊國屋書店 ISBN 978-4314009928 2005年8月) 『子供の仕事』(紀伊國屋書店 ISBN 978-4314009935 2005年8月) 『Fが通過します』(マガジンハウス ISBN 978-4838790098 2006年8月)
○作品集
『佐藤雅彦全仕事』(マドラ出版 ISBN 978-4944079070 1996年6月) 『佐藤雅彦』(ギンザグラフィックギャラリー ISBN 978-4887523494 2005年8月) 佐藤雅彦、古別府泰子、内野真澄編集。
○共著
『バザールでござーるの小冒険』(東京書籍 ISBN 978-4487753772 1994年8月) 佐藤雅彦、内野真澄、水口克夫著。 『バザールでござーるのバナナ裁判』(東京書籍 ISBN 978-4487754359 1995年10月) 佐藤雅彦、内野真澄、水口克夫著。 『だんご3兄弟のえほん―NHKおかあさんといっしょ』(日本放送出版協会 ISBN 978-4144071188 1995年5月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『だんご3兄弟ぱたぱたえほん』(日本放送出版協会 ISBN 978-4140360774 1999年6月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『だんご3兄弟シールえほん』(日本放送出版協会 ISBN 978-4063272420 1999年7月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『だんご3兄弟 あっという間劇場』(日本放送出版協会 ISBN 978-4140360798 1999年10月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『経済ってそういうことだったのか会議』(日本経済新聞社 ISBN 978-4532148249 2000年4月) 佐藤雅彦、竹中平蔵著。 『動け演算―16 flipbooks』(トランスアート ISBN 978-4924956773 2000年4月) 佐藤 雅彦、佐藤雅彦研究室、沢水潤著。 『だんご3兄弟あっという間劇場8本勝負―NHKおかあさんといっしょ』(日本放送出版協会 ISBN 978-4144071218 2000年6月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『だんご3兄弟あっという間劇場 (ごっつぁんです!)』(日本放送出版協会 ISBN 978-4144071225 2001年1月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『だんご3兄弟あっという間劇場 (出前3丁!)』(日本放送出版協会 ISBN 978-4144071232 2001年4月) 佐藤雅彦、内野真澄著。 『NHKピタゴラスイッチアルゴリズムたいそう―おまけおとうさんスイッチ』(日本放送出版協会 ISBN 978-4144071263 2003年2月) 佐藤雅彦、内野真澄、いつもここから著。 『任意の点P』(美術出版社 ISBN 978-4568502565 2003年4月) 佐藤雅彦、慶応義塾大学佐藤雅彦研究室著。 『日本のスイッチ』(毎日新聞社 ISBN 978-4620316765 2004年3月) 佐藤雅彦、慶応義塾大学佐藤雅彦研究室著。 『イメージの読み書き』(美術出版社 ISBN 978-4568502787 2005年8月) 佐藤雅彦、慶応義塾大学佐藤雅彦研究室著。 『勝手に広告』(マガジンハウス ISBN 978-4838716913 2006年9月) 佐藤雅彦、中村至男著。 『ぴったりはまるの本』(ポプラ社 ISBN 978-4591094709 2006年10月) 佐藤雅彦、ユーフラテス著。 『やまだ眼』(毎日新聞社 ISBN 978-4620317946 2007年2月) 佐藤雅彦、山田一成(いつもここから)著。