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分子生物学コミュの問題です。

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Klenow fragmentを用いて DNA断片を、32Pで標識するにはどうしたらいいのですか?

わかる方いたら、具体的に教えて下さい!

コメント(2)

Materials
1. 32Pで標識して欲しいDNA断片 (DNA プローブ) を1xTEバッファー (10 mM Tris-HCI, 1 mM EDTA, pH 8.0) に溶液する

2. OLB バッファーの作り方

溶液A: 1.25M Tris-HCl, pH 8.0, 0. 125M MgCl2 (store at 4°C).

溶液B: 1 mL 溶液A, 18 µL 2β-mercaptoethanol (2βメルカプトエタノール), 5 µL of dATP,* 5 µL of dTTP,* 5 µL of dGTP.*

溶液C: 2M HEPES (4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid)の溶液に, 滴定でpH 6.6 になるまでに4M NaOH を滴下する(store at 4°C).

溶液D: HexadeoxyribonucleotidesをTEに溶解する, pH 8.0, at 90 OD260 U/mL (store at -20°C).

OLB bufferを作るために, B溶液とC溶液とD溶液を100:250:150の割り合いに混ぜる。
Store OLB at -20°C.

3. A nucleotide labeled at the a position with P-32, (例:32P dCTP);SA 3000 CilmM. Store at -20°C.

4. Klenow (1 U/µL). Store at -20°C.

5. 10 mg/mLの Bovine serum albumin (BSA)を蒸留水に溶解する

*各ヌクレオチド(nucleotide) を 3 mMTns-HC1,0.2 mM EDTA, pH7.0, 0.1M にあらかじめ溶解する。

Methods
1. 30 ng のDNA プローブをチューブに移し、蒸留水を全体量31 µLになるように加える。

2. 三分間DNAミクスをボイルすると、チューブを氷上に置く。

3. 10 µL OLB buffer, 2 µL の10 mg/mL BSA, 5 µL labeled nucleotide, 2 µL Klenow fragmentを加え、ピペットマンで静かに混ぜる。

4. 4-16 時間室温でインキュベートする。

できた!


Smith R. D. (1996) Random Primed 32P-Labeling of DNA .Basic DNA and RNA Protocols Methods in Molecular Biology, Volume 58, Part I, 27-29.
http://www.springerlink.com/content/g7508053723370j2/#section=90154&page=1&locus=94
ご丁寧な解答ありがとうございましたわーい(嬉しい顔)!

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