〜計算速度はBlueGene/Lの3倍!!!〜
MDGRAPEは分子動力学(MD)シミュレーションに特化した専用計算機です。MDシミュレーションでは、ニュートンの運動方程式を数値積分で解いて原子の動きを計算しており、特に非結合力(クーロン力やファンデアワールス力)の計算に大半の時間を費やします。MDGRAPEはこの非結合力を高速に計算する計算機です。
使ってる人も、使おうとしている人も、まったく知らない人も大歓迎です。ライブラリや並列化などなど、情報の交換など出来たらと思います。
●MDGRAPE-3/GSC RIKEN
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