ちなみに4GB超のファイルを取り扱うにはいくつかありますが、Intel Macならば、NTFSフォーマットをつかって、MacOSXの方に「Paragon NTFS for Mac OS X 6」
http://shop.vector.co.jp/service/servlet/Catalogue.Detail.Top?ITEM_NO=SR144722
を入れるという手もあります。
最近8GBの動画データを納品することがあって、NTFSな16GBのUSBメモリを使ってデータ交換しました・・・。
起動パーティションとしてNTFSが使えるとかいってますけど、試してません。
WindowsのCygwinもcp, rm使えますから、Paragon NTFS for Mac OS X 6で読み込むpパーティションでもcp, rmコマンドは使えるんじゃないかと思います。
(今度手持ちのUSBメモリをNTFSフォーマットして試してみます)